ישנם גורמים שונים שעלולים להוביל לחוסר בעצם, ובהם ספיגה הדרגתית של עצם הלסת באזור בו לא קיימות שיניים, מחלות חניכיים, טראומה לאזור השיניים וכן גם ניתוחים שונים באזור הפה.
חוסר העצם יכול להתבטא כחסר אופקי (ברוחב הלסת), או כחסר אנכי (בגובה הלסת). לכן, טרם ביצוע של השתלת עצם יש לאבחן את הבעיה נכונה באמצעות צילומי רנטגן כדי לבחור את ההליך המתאים.